心源性栓塞多同时累及浅表和深处的大脑区域，或同时累及前脑和后脑等多个血管供血区，心源性血栓也常同时栓塞双侧前叶脑组织。与非房颤患者脑栓塞相比，房颤引起的脑卒中往往更严重。其中致死性脑卒中占25％，而致死性脑卒中在非房颤患者占14％；以BI指数作为判断脑卒中严重性指标，发现房颤脑卒中在急性期发生严重神经损害的占73.3％，而非房颤患者为32.5％，一年后严重功能障碍的比例在房颤忠者为30.0％，而非房颤患者为10.9％。6个月内冉次发生脑卒中的比例在房颤患者和非房颤患者的比例分别为47％和20％。可见房颤引起的脑卒中是老年患者致死致残的重要原因。